Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CLTCL1P53675 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLTCL1P53675 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLTCL1P53675 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CLTCL1P53675 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CLTCL1P53675 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CLTCL1P53675 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CLTCL1P53675 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CLTCL1P53675 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CLTCL1P53675 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CLTCL1P53675 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLTCL1P53675 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLTCL1P53675 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLTCL1P53675 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CLTCL1P53675 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CLTCL1P53675 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CLTCL1P53675 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CLTCL1P53675 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms