Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP5P51878 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP5P51878 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP5P51878 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP5P51878 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP5P51878 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP5P51878 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP5P51878 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP5P51878 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP5P51878 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP5P51878 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP5P51878 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP5P51878 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP5P51878 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP5P51878 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP5P51878 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP5P51878 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP5P51878 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP5P51878 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP5P51878 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP5P51878 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP5P51878 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP5P51878 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP5P51878 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP5P51878 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP5P51878 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP5P51878 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP5P51878 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP5P51878 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP5P51878 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP5P51878 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP5P51878 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP5P51878 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP5P51878 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP5P51878 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP5P51878 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP5P51878 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP5P51878 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP5P51878 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP5P51878 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP5P51878 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP5P51878 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP5P51878 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP5P51878 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP5P51878 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP5P51878 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP5P51878 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP5P51878 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP5P51878 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP5P51878 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP5P51878 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP5P51878 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP5P51878 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP5P51878 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP5P51878 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP5P51878 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP5P51878 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP5P51878 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP5P51878 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP5P51878 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP5P51878 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP5P51878 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP5P51878 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP5P51878 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP5P51878 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP5P51878 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP5P51878 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CASP5P51878 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CASP5P51878 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CASP5P51878 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP5P51878 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP5P51878 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP5P51878 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP5P51878 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP5P51878 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP5P51878 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP5P51878 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP5P51878 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP5P51878 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP5P51878 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP5P51878 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP5P51878 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP5P51878 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP5P51878 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP5P51878 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP5P51878 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP5P51878 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP5P51878 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP5P51878 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP5P51878 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP5P51878 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP5P51878 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP5P51878 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP5P51878 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP5P51878 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP5P51878 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP5P51878 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP5P51878 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP5P51878 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP5P51878 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms