Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCD1P33897 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCD1P33897 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1808 ms