Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMO2P25791 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMO2P25791 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMO2P25791 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMO2P25791 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMO2P25791 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMO2P25791 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMO2P25791 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LMO2P25791 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO2P25791 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO2P25791 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO2P25791 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO2P25791 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO2P25791 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO2P25791 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO2P25791 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO2P25791 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO2P25791 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO2P25791 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO2P25791 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO2P25791 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO2P25791 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO2P25791 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO2P25791 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO2P25791 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO2P25791 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO2P25791 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO2P25791 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO2P25791 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO2P25791 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO2P25791 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO2P25791 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO2P25791 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO2P25791 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMO2P25791 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO2P25791 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO2P25791 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO2P25791 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO2P25791 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO2P25791 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO2P25791 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO2P25791 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO2P25791 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO2P25791 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMO2P25791 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMO2P25791 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMO2P25791 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMO2P25791 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LMO2P25791 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMO2P25791 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMO2P25791 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMO2P25791 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO2P25791 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO2P25791 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO2P25791 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO2P25791 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO2P25791 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO2P25791 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO2P25791 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO2P25791 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO2P25791 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO2P25791 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO2P25791 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO2P25791 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO2P25791 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO2P25791 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO2P25791 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO2P25791 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMO2P25791 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMO2P25791 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMO2P25791 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMO2P25791 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMO2P25791 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMO2P25791 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMO2P25791 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMO2P25791 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMO2P25791 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMO2P25791 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMO2P25791 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMO2P25791 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMO2P25791 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMO2P25791 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMO2P25791 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMO2P25791 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMO2P25791 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LMO2P25791 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMO2P25791 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMO2P25791 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMO2P25791 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMO2P25791 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMO2P25791 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMO2P25791 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LMO2P25791 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMO2P25791 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMO2P25791 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMO2P25791 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMO2P25791 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMO2P25791 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMO2P25791 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMO2P25791 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms