Protein–RNA interactions for Protein: P21108

PRPS1L1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1L1P21108 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPS1L1P21108 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms