Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RXRAP19793 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RXRAP19793 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RXRAP19793 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RXRAP19793 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RXRAP19793 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RXRAP19793 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RXRAP19793 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RXRAP19793 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RXRAP19793 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RXRAP19793 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RXRAP19793 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RXRAP19793 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RXRAP19793 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RXRAP19793 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RXRAP19793 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RXRAP19793 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RXRAP19793 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RXRAP19793 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RXRAP19793 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RXRAP19793 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RXRAP19793 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RXRAP19793 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RXRAP19793 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RXRAP19793 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RXRAP19793 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RXRAP19793 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RXRAP19793 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RXRAP19793 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RXRAP19793 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RXRAP19793 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RXRAP19793 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RXRAP19793 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RXRAP19793 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RXRAP19793 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RXRAP19793 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RXRAP19793 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RXRAP19793 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RXRAP19793 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RXRAP19793 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RXRAP19793 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RXRAP19793 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RXRAP19793 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RXRAP19793 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RXRAP19793 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RXRAP19793 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RXRAP19793 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RXRAP19793 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RXRAP19793 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RXRAP19793 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RXRAP19793 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RXRAP19793 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RXRAP19793 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RXRAP19793 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RXRAP19793 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RXRAP19793 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RXRAP19793 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RXRAP19793 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RXRAP19793 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RXRAP19793 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RXRAP19793 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RXRAP19793 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RXRAP19793 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RXRAP19793 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RXRAP19793 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RXRAP19793 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RXRAP19793 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RXRAP19793 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RXRAP19793 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RXRAP19793 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RXRAP19793 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RXRAP19793 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RXRAP19793 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RXRAP19793 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RXRAP19793 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RXRAP19793 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RXRAP19793 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RXRAP19793 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RXRAP19793 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RXRAP19793 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RXRAP19793 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RXRAP19793 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RXRAP19793 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RXRAP19793 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RXRAP19793 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RXRAP19793 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RXRAP19793 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RXRAP19793 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RXRAP19793 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RXRAP19793 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RXRAP19793 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RXRAP19793 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RXRAP19793 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RXRAP19793 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RXRAP19793 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RXRAP19793 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RXRAP19793 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RXRAP19793 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RXRAP19793 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RXRAP19793 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms