Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF7P17544 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF7P17544 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF7P17544 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF7P17544 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF7P17544 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF7P17544 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF7P17544 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF7P17544 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF7P17544 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF7P17544 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF7P17544 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF7P17544 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF7P17544 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF7P17544 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF7P17544 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF7P17544 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF7P17544 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF7P17544 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF7P17544 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATF7P17544 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF7P17544 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF7P17544 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF7P17544 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF7P17544 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF7P17544 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF7P17544 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF7P17544 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF7P17544 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF7P17544 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF7P17544 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF7P17544 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF7P17544 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF7P17544 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF7P17544 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF7P17544 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF7P17544 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF7P17544 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF7P17544 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF7P17544 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF7P17544 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF7P17544 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF7P17544 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF7P17544 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF7P17544 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF7P17544 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF7P17544 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF7P17544 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF7P17544 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF7P17544 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF7P17544 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF7P17544 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF7P17544 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF7P17544 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF7P17544 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF7P17544 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF7P17544 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF7P17544 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF7P17544 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATF7P17544 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF7P17544 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF7P17544 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF7P17544 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF7P17544 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF7P17544 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF7P17544 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATF7P17544 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ATF7P17544 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF7P17544 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF7P17544 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF7P17544 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF7P17544 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF7P17544 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF7P17544 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF7P17544 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF7P17544 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF7P17544 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF7P17544 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF7P17544 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATF7P17544 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF7P17544 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF7P17544 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF7P17544 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF7P17544 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATF7P17544 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF7P17544 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF7P17544 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF7P17544 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATF7P17544 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF7P17544 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF7P17544 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF7P17544 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF7P17544 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF7P17544 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF7P17544 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF7P17544 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF7P17544 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF7P17544 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF7P17544 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATF7P17544 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms