Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STMN1P16949 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STMN1P16949 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STMN1P16949 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STMN1P16949 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STMN1P16949 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STMN1P16949 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STMN1P16949 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STMN1P16949 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STMN1P16949 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STMN1P16949 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STMN1P16949 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STMN1P16949 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STMN1P16949 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STMN1P16949 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STMN1P16949 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STMN1P16949 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STMN1P16949 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STMN1P16949 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STMN1P16949 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STMN1P16949 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STMN1P16949 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
STMN1P16949 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STMN1P16949 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STMN1P16949 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STMN1P16949 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STMN1P16949 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STMN1P16949 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STMN1P16949 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STMN1P16949 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STMN1P16949 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STMN1P16949 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STMN1P16949 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STMN1P16949 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STMN1P16949 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
STMN1P16949 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STMN1P16949 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STMN1P16949 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STMN1P16949 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STMN1P16949 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STMN1P16949 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STMN1P16949 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STMN1P16949 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STMN1P16949 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STMN1P16949 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STMN1P16949 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STMN1P16949 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STMN1P16949 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STMN1P16949 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STMN1P16949 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STMN1P16949 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STMN1P16949 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STMN1P16949 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STMN1P16949 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STMN1P16949 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STMN1P16949 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STMN1P16949 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STMN1P16949 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STMN1P16949 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STMN1P16949 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STMN1P16949 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STMN1P16949 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STMN1P16949 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STMN1P16949 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STMN1P16949 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STMN1P16949 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STMN1P16949 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STMN1P16949 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STMN1P16949 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STMN1P16949 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STMN1P16949 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STMN1P16949 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STMN1P16949 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STMN1P16949 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
STMN1P16949 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STMN1P16949 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STMN1P16949 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STMN1P16949 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STMN1P16949 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STMN1P16949 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STMN1P16949 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STMN1P16949 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STMN1P16949 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STMN1P16949 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STMN1P16949 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STMN1P16949 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STMN1P16949 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
STMN1P16949 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
STMN1P16949 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STMN1P16949 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STMN1P16949 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STMN1P16949 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STMN1P16949 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STMN1P16949 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STMN1P16949 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STMN1P16949 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STMN1P16949 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STMN1P16949 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STMN1P16949 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STMN1P16949 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms