Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
GLI2P10070 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
GLI2P10070 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
GLI2P10070 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
GLI2P10070 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
GLI2P10070 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.44
GLI2P10070 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
GLI2P10070 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
GLI2P10070 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
GLI2P10070 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
GLI2P10070 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
GLI2P10070 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
GLI2P10070 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
GLI2P10070 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
GLI2P10070 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GLI2P10070 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GLI2P10070 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
GLI2P10070 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
GLI2P10070 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GLI2P10070 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
GLI2P10070 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GLI2P10070 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GLI2P10070 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
GLI2P10070 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
GLI2P10070 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
GLI2P10070 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
GLI2P10070 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
GLI2P10070 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
GLI2P10070 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
GLI2P10070 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GLI2P10070 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
GLI2P10070 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GLI2P10070 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GLI2P10070 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GLI2P10070 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GLI2P10070 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GLI2P10070 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
GLI2P10070 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GLI2P10070 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
GLI2P10070 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GLI2P10070 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GLI2P10070 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GLI2P10070 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GLI2P10070 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GLI2P10070 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GLI2P10070 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GLI2P10070 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GLI2P10070 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GLI2P10070 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GLI2P10070 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GLI2P10070 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GLI2P10070 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GLI2P10070 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
GLI2P10070 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
GLI2P10070 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GLI2P10070 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
GLI2P10070 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GLI2P10070 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
GLI2P10070 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
GLI2P10070 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GLI2P10070 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
GLI2P10070 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GLI2P10070 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
GLI2P10070 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
GLI2P10070 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
GLI2P10070 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
GLI2P10070 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
GLI2P10070 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
GLI2P10070 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
GLI2P10070 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36.38■■■■□ 3.41
GLI2P10070 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
GLI2P10070 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
GLI2P10070 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
GLI2P10070 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
GLI2P10070 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GLI2P10070 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
GLI2P10070 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
GLI2P10070 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
GLI2P10070 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
GLI2P10070 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GLI2P10070 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GLI2P10070 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
GLI2P10070 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
GLI2P10070 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
GLI2P10070 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
GLI2P10070 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GLI2P10070 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
GLI2P10070 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GLI2P10070 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
GLI2P10070 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
GLI2P10070 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
GLI2P10070 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
GLI2P10070 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GLI2P10070 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GLI2P10070 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GLI2P10070 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
GLI2P10070 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
GLI2P10070 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
GLI2P10070 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
GLI2P10070 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms