Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAA2P0DJI9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAA2P0DJI9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAA2P0DJI9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms