Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA6AP0CW24 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA6AP0CW24 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA6AP0CW24 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms