Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM2P07951 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPM2P07951 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPM2P07951 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPM2P07951 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM2P07951 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM2P07951 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM2P07951 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM2P07951 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM2P07951 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM2P07951 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM2P07951 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM2P07951 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM2P07951 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM2P07951 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM2P07951 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPM2P07951 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPM2P07951 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPM2P07951 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPM2P07951 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPM2P07951 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPM2P07951 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPM2P07951 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPM2P07951 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPM2P07951 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPM2P07951 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPM2P07951 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPM2P07951 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPM2P07951 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPM2P07951 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPM2P07951 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPM2P07951 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPM2P07951 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPM2P07951 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPM2P07951 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPM2P07951 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPM2P07951 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPM2P07951 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPM2P07951 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPM2P07951 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPM2P07951 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPM2P07951 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPM2P07951 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TPM2P07951 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPM2P07951 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPM2P07951 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPM2P07951 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPM2P07951 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPM2P07951 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPM2P07951 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPM2P07951 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPM2P07951 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPM2P07951 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPM2P07951 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPM2P07951 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPM2P07951 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPM2P07951 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPM2P07951 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPM2P07951 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPM2P07951 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPM2P07951 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPM2P07951 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPM2P07951 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPM2P07951 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPM2P07951 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPM2P07951 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPM2P07951 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPM2P07951 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPM2P07951 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPM2P07951 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPM2P07951 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPM2P07951 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPM2P07951 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPM2P07951 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPM2P07951 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPM2P07951 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TPM2P07951 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPM2P07951 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPM2P07951 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPM2P07951 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPM2P07951 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPM2P07951 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TPM2P07951 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TPM2P07951 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TPM2P07951 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TPM2P07951 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TPM2P07951 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TPM2P07951 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TPM2P07951 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TPM2P07951 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPM2P07951 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPM2P07951 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPM2P07951 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPM2P07951 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPM2P07951 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPM2P07951 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPM2P07951 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TPM2P07951 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPM2P07951 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TPM2P07951 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms