Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED1O96006 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED1O96006 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED1O96006 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZBED1O96006 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms