Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRD1O95696 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRD1O95696 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRD1O95696 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRD1O95696 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRD1O95696 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRD1O95696 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRD1O95696 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRD1O95696 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRD1O95696 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
BRD1O95696 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRD1O95696 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRD1O95696 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRD1O95696 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRD1O95696 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRD1O95696 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRD1O95696 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRD1O95696 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRD1O95696 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRD1O95696 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRD1O95696 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRD1O95696 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRD1O95696 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRD1O95696 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRD1O95696 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRD1O95696 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRD1O95696 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRD1O95696 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRD1O95696 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRD1O95696 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRD1O95696 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRD1O95696 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRD1O95696 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRD1O95696 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRD1O95696 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRD1O95696 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRD1O95696 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRD1O95696 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRD1O95696 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRD1O95696 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRD1O95696 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRD1O95696 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRD1O95696 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRD1O95696 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRD1O95696 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRD1O95696 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRD1O95696 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRD1O95696 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRD1O95696 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRD1O95696 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRD1O95696 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRD1O95696 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRD1O95696 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
BRD1O95696 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRD1O95696 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRD1O95696 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRD1O95696 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRD1O95696 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRD1O95696 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRD1O95696 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRD1O95696 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRD1O95696 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRD1O95696 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BRD1O95696 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRD1O95696 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRD1O95696 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRD1O95696 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRD1O95696 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BRD1O95696 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRD1O95696 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRD1O95696 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRD1O95696 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRD1O95696 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRD1O95696 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRD1O95696 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BRD1O95696 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRD1O95696 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRD1O95696 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRD1O95696 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRD1O95696 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRD1O95696 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRD1O95696 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRD1O95696 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRD1O95696 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRD1O95696 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRD1O95696 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRD1O95696 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRD1O95696 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRD1O95696 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRD1O95696 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRD1O95696 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRD1O95696 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRD1O95696 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRD1O95696 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRD1O95696 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
BRD1O95696 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRD1O95696 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
BRD1O95696 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRD1O95696 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BRD1O95696 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms