Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1GO43497 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1GO43497 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA1GO43497 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1GO43497 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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