Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTRA2O43464 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA2O43464 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms