Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF113AO15541 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF113AO15541 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF113AO15541 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms