Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP290O15078 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP290O15078 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP290O15078 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP290O15078 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP290O15078 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP290O15078 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP290O15078 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP290O15078 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP290O15078 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP290O15078 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP290O15078 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP290O15078 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP290O15078 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP290O15078 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CEP290O15078 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP290O15078 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP290O15078 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP290O15078 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP290O15078 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP290O15078 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP290O15078 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP290O15078 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP290O15078 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CEP290O15078 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CEP290O15078 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CEP290O15078 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CEP290O15078 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CEP290O15078 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CEP290O15078 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CEP290O15078 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEP290O15078 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CEP290O15078 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEP290O15078 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEP290O15078 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEP290O15078 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEP290O15078 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP290O15078 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP290O15078 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP290O15078 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP290O15078 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP290O15078 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP290O15078 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP290O15078 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP290O15078 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP290O15078 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP290O15078 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP290O15078 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP290O15078 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP290O15078 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP290O15078 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP290O15078 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP290O15078 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP290O15078 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP290O15078 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP290O15078 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP290O15078 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP290O15078 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP290O15078 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP290O15078 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP290O15078 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP290O15078 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP290O15078 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP290O15078 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP290O15078 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP290O15078 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP290O15078 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP290O15078 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP290O15078 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP290O15078 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP290O15078 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP290O15078 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP290O15078 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP290O15078 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP290O15078 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP290O15078 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP290O15078 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP290O15078 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP290O15078 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP290O15078 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP290O15078 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP290O15078 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP290O15078 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEP290O15078 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEP290O15078 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEP290O15078 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEP290O15078 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP290O15078 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP290O15078 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP290O15078 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP290O15078 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP290O15078 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP290O15078 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP290O15078 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP290O15078 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP290O15078 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP290O15078 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP290O15078 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP290O15078 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP290O15078 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
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