Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
N4BP3O15049 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
N4BP3O15049 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
N4BP3O15049 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms