Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
IFIT3O14879 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFIT3O14879 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFIT3O14879 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFIT3O14879 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms