Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF103O00237 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF103O00237 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF103O00237 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF103O00237 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF103O00237 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF103O00237 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF103O00237 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF103O00237 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF103O00237 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF103O00237 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF103O00237 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF103O00237 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF103O00237 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF103O00237 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF103O00237 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF103O00237 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF103O00237 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF103O00237 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF103O00237 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF103O00237 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF103O00237 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF103O00237 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF103O00237 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF103O00237 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF103O00237 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF103O00237 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF103O00237 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF103O00237 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF103O00237 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF103O00237 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF103O00237 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF103O00237 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF103O00237 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF103O00237 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF103O00237 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF103O00237 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF103O00237 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF103O00237 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF103O00237 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF103O00237 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF103O00237 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF103O00237 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF103O00237 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF103O00237 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF103O00237 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF103O00237 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF103O00237 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF103O00237 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF103O00237 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF103O00237 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF103O00237 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF103O00237 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF103O00237 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF103O00237 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF103O00237 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF103O00237 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF103O00237 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF103O00237 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF103O00237 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF103O00237 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF103O00237 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF103O00237 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF103O00237 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF103O00237 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF103O00237 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF103O00237 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF103O00237 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF103O00237 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF103O00237 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF103O00237 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF103O00237 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF103O00237 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF103O00237 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF103O00237 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF103O00237 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF103O00237 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF103O00237 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF103O00237 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF103O00237 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF103O00237 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF103O00237 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF103O00237 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF103O00237 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF103O00237 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF103O00237 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF103O00237 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF103O00237 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF103O00237 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF103O00237 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF103O00237 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF103O00237 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF103O00237 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF103O00237 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF103O00237 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF103O00237 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF103O00237 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF103O00237 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF103O00237 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF103O00237 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms