Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
J3KR12 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
J3KR12 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
J3KR12 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
J3KR12 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
J3KR12 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
J3KR12 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
J3KR12 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
J3KR12 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
J3KR12 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
J3KR12 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
J3KR12 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
J3KR12 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
J3KR12 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
J3KR12 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
J3KR12 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
J3KR12 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
J3KR12 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
J3KR12 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
J3KR12 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
J3KR12 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
J3KR12 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
J3KR12 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
J3KR12 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
J3KR12 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
J3KR12 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
J3KR12 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
J3KR12 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
J3KR12 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
J3KR12 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
J3KR12 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
J3KR12 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
J3KR12 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
J3KR12 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
J3KR12 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
J3KR12 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
J3KR12 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
J3KR12 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
J3KR12 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
J3KR12 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
J3KR12 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
J3KR12 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
J3KR12 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
J3KR12 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
J3KR12 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
J3KR12 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
J3KR12 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
J3KR12 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
J3KR12 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
J3KR12 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
J3KR12 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
J3KR12 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
J3KR12 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
J3KR12 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
J3KR12 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
J3KR12 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
J3KR12 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
J3KR12 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
J3KR12 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
J3KR12 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
J3KR12 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
J3KR12 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
J3KR12 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
J3KR12 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
J3KR12 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
J3KR12 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
J3KR12 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
J3KR12 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
J3KR12 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
J3KR12 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
J3KR12 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
J3KR12 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
J3KR12 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
J3KR12 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
J3KR12 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
J3KR12 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
J3KR12 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
J3KR12 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
J3KR12 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
J3KR12 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
J3KR12 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
J3KR12 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
J3KR12 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
J3KR12 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
J3KR12 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
J3KR12 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
J3KR12 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
J3KR12 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
J3KR12 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
J3KR12 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
J3KR12 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
J3KR12 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
J3KR12 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
J3KR12 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
J3KR12 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
J3KR12 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
J3KR12 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
J3KR12 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
J3KR12 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
J3KR12 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms