Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SSC5DA1L4H1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SSC5DA1L4H1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSC5DA1L4H1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms