Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRBV5-3A0A0A0MS03 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRBV5-3A0A0A0MS03 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV5-3A0A0A0MS03 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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