Protein–RNA interactions for Protein: V9GYH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYH0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
V9GYH0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
V9GYH0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
V9GYH0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
V9GYH0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
V9GYH0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
V9GYH0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
V9GYH0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
V9GYH0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
V9GYH0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
V9GYH0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
V9GYH0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
V9GYH0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
V9GYH0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
V9GYH0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
V9GYH0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
V9GYH0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
V9GYH0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
V9GYH0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
V9GYH0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
V9GYH0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
V9GYH0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
V9GYH0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
V9GYH0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
V9GYH0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
V9GYH0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
V9GYH0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
V9GYH0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
V9GYH0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
V9GYH0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
V9GYH0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
V9GYH0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
V9GYH0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
V9GYH0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
V9GYH0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
V9GYH0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYH0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYH0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYH0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYH0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYH0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYH0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYH0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYH0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
V9GYH0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYH0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYH0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYH0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYH0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYH0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
V9GYH0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYH0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYH0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYH0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYH0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYH0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYH0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYH0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYH0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
V9GYH0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYH0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYH0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYH0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYH0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYH0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYH0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYH0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
V9GYH0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYH0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYH0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYH0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYH0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYH0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYH0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYH0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYH0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYH0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYH0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYH0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYH0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYH0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYH0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
V9GYH0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
V9GYH0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
V9GYH0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
V9GYH0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
V9GYH0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
V9GYH0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
V9GYH0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
V9GYH0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
V9GYH0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
V9GYH0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
V9GYH0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
V9GYH0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
V9GYH0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
V9GYH0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
V9GYH0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
V9GYH0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
V9GYH0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
V9GYH0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms