Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PMF1-BGLAPU3KQ54 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PMF1-BGLAPU3KQ54 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms