Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2C9

TLR6, Toll-like receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR6Q9Y2C9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR6Q9Y2C9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms