Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHA12Q9UN75 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCDHA12Q9UN75 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDHA12Q9UN75 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms