Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLEC4AQ9UMR7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLEC4AQ9UMR7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLEC4AQ9UMR7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms