Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV5

RAPGEFL1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEFL1Q9UHV5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAPGEFL1Q9UHV5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAPGEFL1Q9UHV5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms