Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SS18L2Q9UHA2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SS18L2Q9UHA2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144 ms