Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DKK2Q9UBU2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DKK2Q9UBU2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms