Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS18Q9P253 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS18Q9P253 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms