Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPG21Q9NZD8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPG21Q9NZD8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms