Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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RDH8Q9NYR8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RDH8Q9NYR8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RDH8Q9NYR8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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