Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D2Q9NY47 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D2Q9NY47 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D2Q9NY47 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms