Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRMT1Q9NXH9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRMT1Q9NXH9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms