Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BSDC1Q9NW68 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BSDC1Q9NW68 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BSDC1Q9NW68 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms