Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM9Q9NQV7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDM9Q9NQV7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM9Q9NQV7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms