Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NTN4Q9HB63 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NTN4Q9HB63 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms