Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SSBP4Q9BWG4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSBP4Q9BWG4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms