Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GORASP1Q9BQQ3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GORASP1Q9BQQ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GORASP1Q9BQQ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms