Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RETNLBQ9BQ08 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RETNLBQ9BQ08 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms