Protein–RNA interactions for Protein: Q99727

TIMP4, Metalloproteinase inhibitor 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP4Q99727 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMP4Q99727 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMP4Q99727 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMP4Q99727 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMP4Q99727 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMP4Q99727 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMP4Q99727 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMP4Q99727 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMP4Q99727 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMP4Q99727 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMP4Q99727 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMP4Q99727 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMP4Q99727 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMP4Q99727 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMP4Q99727 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMP4Q99727 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TIMP4Q99727 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMP4Q99727 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms