Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD5Q99717 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD5Q99717 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms