Protein–RNA interactions for Protein: Q96T68

SETDB2, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB2Q96T68 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SETDB2Q96T68 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SETDB2Q96T68 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SETDB2Q96T68 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SETDB2Q96T68 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms