Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00208Q96KT6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00208Q96KT6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms