Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NEURL4Q96JN8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.45■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NEURL4Q96JN8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
NEURL4Q96JN8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
NEURL4Q96JN8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms