Protein–RNA interactions for Protein: Q96DW6

SLC25A38, Solute carrier family 25 member 38, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A38Q96DW6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC25A38Q96DW6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC25A38Q96DW6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC25A38Q96DW6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC25A38Q96DW6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC25A38Q96DW6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC25A38Q96DW6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms