Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP6V1E2Q96A05 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms